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X annonce à Scully qu’une pièce métallique vient d’être retirée de sa nuque. Cet implant serait à l’origine des étranges phénomènes qui perturbent la jeune femme depuis quelque temps. Parallèlement, Mulder, juché sur le toit d’un train roulant en direction du Canada, réussit à se mettre à l’abri dans un des wagons. Avec l’aide du conducteur du convoi, Mulder se lance sur les traces du docteur Shiro Zama. Il est en effet persuadé que c’est lui qui est à l’origine des étranges manipulations sur lesquelles le F.B.I. enquête. Mais ‘ l’homme aux cheveux rouges’, qui s’est déjà rendu coupable du meurtre d’un diplomate japonais, les devance. Il tue le professeur Zama et abandonne le cadavre dans les toilettes…, Tandis que Scully poursuit ses recherches sur l’implant métallique qu’elle portait en elle, Mulder se retrouve pris au piège dans le train censé contenir le cadavre d’un extra-terrestre. Le problème, c’est qu’il n’est pas tout seul : un assassin a été chargé d’éliminer le savant japonais qui a en charge le corps en question…, Scully apprend qu’une pièce métallique a été retirée de sa nuque. Quant à Mulder, il poursuit son enquête sur le docteur Shiro Zama., Alors que Scully commence à en apprendre davantage sur la puce qui lui a été retirée du cou, Mulder s’est embarqué sur un train contenant des explosifs. La piste de chacun des agents conduit vers la même personne, le docteur Shiro Zama, qui aurait commandé des puces électroniques pour son centre de recherches et utiliserait ce train pour faire sortir du territoire américain une créature qu’il veut protéger.
